第一篇:分子生物學(xué)總結(jié)
SectionA 1 三個(gè)域:真細(xì)菌,古細(xì)菌,真核生物 2 組裝中的主要作用力:非共價(jià)健作用力
SectionB 1 蛋白質(zhì)純化的分析方法
正電荷:天冬氨酸 谷氨酸
負(fù)電荷:賴氨酸 精氨酸
組氨酸
極性:天冬酰胺 谷氨酰胺
蘇氨酸 絲氨酸 半胱氨酸
非極性:脂肪族 甘氨酸 丙氨酸 纈氨酸 亮氨酸
異亮氨酸 甲硫氨酸 脯氨酸
芳香族 苯丙氨酸
酪氨酸 色氨酸 Cys 二硫鍵 Gly 無手性 Pro 亞氨基酸
芳香族氨基酸最大吸收峰280mm 3 蛋白質(zhì)的一級(jí)(決定蛋白折疊及其最后的形狀的最重要的因素):氨基酸脫水縮合形成肽鏈 N端到C端
共價(jià)鍵
二級(jí):多肽鏈中空間結(jié)構(gòu)鄰近的肽鏈骨架通過氫鍵形成的特殊結(jié)構(gòu)。
α轉(zhuǎn)角
β螺旋 氫鍵為主要作用力
三級(jí): 多肽鏈中的所有二級(jí)結(jié)構(gòu)和其他松散肽鏈區(qū)域(散環(huán)結(jié)構(gòu))通過各種分子間作用力(非共價(jià)鍵為主),彎曲、折疊成具有特定走向的緊密球狀構(gòu)象。
非共價(jià)鍵
四級(jí): 許多蛋白分子由多條多肽鏈(亞基,subunits)構(gòu)成。組成蛋白的各亞基以各種非共價(jià)鍵作用力為主,結(jié)合形成的立體空間結(jié)構(gòu)即為四級(jí)結(jié)構(gòu)。非共價(jià)鍵 偶極:電子云在極性共價(jià)鍵的兩原子間不均勻分布,使共價(jià)鍵兩端的原子分別呈現(xiàn)不同的電性
兼性離子:具有正電荷(堿性),又具有負(fù)電荷(酸性)的分子 雙極性分子:
Section C 1核酸的光學(xué)特性:
增色性:一種化合物隨著結(jié)構(gòu)的改變對(duì)光的吸收能力增加的現(xiàn)象 減色性:一種化合物隨著結(jié)構(gòu)的改變對(duì)光的吸收能力減少的現(xiàn)象 Reason: 堿基環(huán)暴露在環(huán)境中的越多,對(duì)紫外的吸收力越強(qiáng) Absorbance(吸收值):Nucleotide > ssDNA/RNA > dsDNA 核酸的最大吸收峰260mm(堿基有芳香環(huán))芳香族氨基酸最大吸收峰280mm A260/A280:
純的 dsDNA:1.8 純的 RNA:2.0 純的 Protein:0.5 2 Tm 值(熔解溫度):熱變性時(shí),使得DNA雙鏈解開一半所需要的溫度。
Tm=2x(A+T)+ 4x(G+C)
Tm值與DNA分子的長度,及GC的含量成正比
Annealing(退火):熱變性的DNA經(jīng)過緩慢冷卻后復(fù)性
快速冷卻: Stay as ssDNA
緩慢冷卻: 復(fù)性成dsDNA 3 脫氧核糖核酸與核糖核苷酸得到畫法 支持雙螺旋結(jié)構(gòu)的兩個(gè)實(shí)驗(yàn):查戈夫規(guī)則
X射線晶體衍射 5 雙螺旋的內(nèi)容:
雙鏈之間的關(guān)系:DNA分子由兩條鏈組成
雙鏈反向平行(5’?3’ 方向)
兩鏈的堿基通過氫鍵互補(bǔ)配對(duì),A:T;G:C。
雙鏈序列反向互補(bǔ)
各基團(tuán)排列方式:糖-磷酸骨架DNA分子排列在外;
堿基對(duì)平面相互平行,排列在DNA分子的內(nèi)部??臻g結(jié)構(gòu)為:右手雙螺旋結(jié)構(gòu)
每轉(zhuǎn)一圈~10個(gè)堿基對(duì),每一圈長度33.2A
雙鏈螺旋中形成大溝,小溝。堿對(duì)DNA的影響:高pH值對(duì)DNA的影響比低pH值的要小。
高 pH 值(pH>11)會(huì)改變堿基構(gòu)象,使DNA變性(雙鏈解旋,成單鏈)
RNA的影響:高pH值,2’羥基會(huì)攻擊磷酸二酯鍵,使其斷裂,形成2’,3’-環(huán)式磷酸二酯鍵,從而使RNA分子斷裂 共價(jià)閉合環(huán)狀DNA(convalently closed circular DNA, cccDNA)。即通過共價(jià)鍵結(jié)合形成的封閉環(huán)狀DNA分子。超螺旋DNA(Supercoil DNA):松弛型雙鏈DNA進(jìn)一步旋轉(zhuǎn)后,再形成閉環(huán)結(jié)構(gòu)時(shí),就會(huì)形成DNA超螺旋結(jié)構(gòu)
L=T+W 判斷是否為超螺旋 正負(fù)超螺旋 拓?fù)洚悩?gòu)酶:暫時(shí)斷裂DNA分子中一條或兩條單鏈上的磷酸二酯鍵,改變DNA分子的連接數(shù)及拓?fù)錉顟B(tài)。
功能:消除DNA復(fù)制和轉(zhuǎn)錄等過程產(chǎn)生的超螺旋。
細(xì)胞中,Ⅰ型酶與Ⅱ型酶的活性保持一種平衡狀態(tài)。Ⅱ型酶的“使DNA超螺旋化” 與Ⅰ型酶“使DNA松馳化” 相抗衡,從而使DNA保持適當(dāng)?shù)某菪芏?。EB: 嵌入DNA配對(duì)堿基之間,使DNA分子在嵌入處局部解旋,增加ccDNA其它部位的正超螺旋 Type II RE
二型限制性內(nèi)切酶:識(shí)別位點(diǎn)一般為4~8個(gè)堿基對(duì)的回文序列
如:EcoRI
5’-GAATTC-3’
3’-CTTAAG-5
Section D 1 染色體的折疊:串珠結(jié)構(gòu) :核心組蛋白:H2A, H2B, H3 and H4.連接組蛋白 H1
核小體
30nm纖絲
高級(jí)環(huán)狀結(jié)構(gòu)(染色質(zhì)的最高結(jié)構(gòu))
緊密纏繞結(jié)構(gòu) 著絲粒:兩側(cè)是大量的名叫衛(wèi)星DNA的重復(fù)序列
端粒:上百個(gè)短的重復(fù)序列
作用:端粒DNA 形成特殊的環(huán)狀二級(jí)結(jié)構(gòu),保護(hù)染色體末端不被核酸外切酶降解。
抵消DNA復(fù)制時(shí)每一輪復(fù)制都導(dǎo)致兩末端形成的后隨鏈比母鏈要短一截的現(xiàn)象對(duì)染色體的影響 異染色質(zhì):高度濃縮,無轉(zhuǎn)錄活性
常染色質(zhì):結(jié)構(gòu)松散,有轉(zhuǎn)錄活性
DNaseI 敏感區(qū)域:對(duì)區(qū)域內(nèi)DNA的轉(zhuǎn)錄活躍
串珠結(jié)構(gòu)
DNaseI 超敏感區(qū)域:轉(zhuǎn)錄活躍的基因的調(diào)控區(qū)域
DNA裸露 4 原核染色體結(jié)構(gòu):非特異性DNA結(jié)合蛋白:類組蛋白
位點(diǎn)特異性DNA結(jié)合蛋白:與特殊的DNA序列結(jié)合
有其他特殊的生理功能:RNA polymerases
對(duì)結(jié)構(gòu)域的形成也很重要
復(fù)性動(dòng)力曲線:
Low C0t: 高重復(fù) 衛(wèi)星DNA Moderate C0t : 中重復(fù) 串聯(lián)基因簇
反轉(zhuǎn)座子 High C0t :單拷貝或低重復(fù)
大腸桿菌基因組 染色體結(jié)構(gòu)對(duì)基因轉(zhuǎn)錄的影響
CpG 抑制→CpG位點(diǎn)中的胞嘧啶的C-5常發(fā)生甲基化(CpG甲基化),CpG 甲基化可能可以DNA轉(zhuǎn)錄被限制→哺乳動(dòng)物基因組中,有些區(qū)域含有很多未甲基化的CpG 位點(diǎn),被稱為CpG 孤島。
甲基化—轉(zhuǎn)錄抑制
去甲基化—恢復(fù)轉(zhuǎn)錄
組蛋白的乙?;汉诵慕M蛋白N-端的Lys被乙?;?,DNA與核心組蛋白體解聚。Gene 表達(dá)被激活
去乙酰化:抑制 gene表達(dá)
組蛋白的磷酸化:對(duì)組蛋白 H1 磷酸化,抑制基因表達(dá) 其他組蛋白中心法則
Section E 1 DNA復(fù)制:細(xì)胞中,一條雙鏈DNA分子通過堿基配對(duì),形成兩條與其序列相同的DNA雙鏈分子的過程。2
確定DNA半保留復(fù)制
半不連續(xù)復(fù)制 3 復(fù)制的基本步驟 復(fù)制為雙向
大腸桿菌的復(fù)制:
起始AT含量高的區(qū)域
參與蛋白:DnaA(復(fù)制起始因子):識(shí)別并結(jié)合于重復(fù)序列上,驅(qū)使富含AT的重復(fù)序列解鏈,需負(fù)超螺旋,及ATP
DnaB(DNA解旋酶):DNA雙鏈解旋,形成復(fù)制叉
SSB:(單鏈結(jié)合蛋白):保持解旋部分的單鏈狀態(tài)
DnaG(引發(fā)酶/引物酶):RNA引物合成,引發(fā)復(fù)制 延伸
參與蛋白:DNA Pol III全酶:負(fù)責(zé)新鏈的合成:前導(dǎo)鏈,岡崎片段
DNA pol
I:復(fù)制中除去引物,填補(bǔ)引物處空缺
終止: 真核生物的復(fù)制:
一個(gè)細(xì)胞周期內(nèi),一個(gè)DNA分子只能復(fù)制一次
Section F 1 復(fù)制忠實(shí)性的機(jī)制:
DNA復(fù)制的高精度:模板連和進(jìn)入核苷酸在DNA聚合酶的作用位點(diǎn)正確配對(duì)
3’到5’外切核酸酶對(duì)錯(cuò)誤堿基的校正
錯(cuò)配修復(fù) 2 holiday模型 3
Section K 編碼鏈 模板鏈 2 大腸桿菌的轉(zhuǎn)錄
RNAP酶:核心酶:a 亞基:aNTD對(duì)核心酶的組裝很重要。
aCTD在識(shí)別啟動(dòng)子、調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄水平中起著非常重要的作用。
b 亞基:RNAP的催化中心。
與模板DNA、RNA產(chǎn)物、及底物核糖核苷酸緊密結(jié)合。
抗生素利福平結(jié)合在在b 亞基上,可以抑制RNAP的轉(zhuǎn)錄活性。
利福平只抑制轉(zhuǎn)錄的起始。
利迪鏈菌素只抑制延伸而不抑制轉(zhuǎn)錄起始
b’ 亞基:可能與RNAP的催化有關(guān)。
肝素與b’亞基結(jié)合后,能干擾RNAP與DNA的結(jié)合,抑制轉(zhuǎn)錄。
w 亞基:可能與RNAP的組裝及維持RNAP結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定性有關(guān)
s factor(s因子):s factor 在啟動(dòng)子特異性識(shí)別過程中至關(guān)重要 移動(dòng)慢的原因:可以保持與翻譯同步。
與有些基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控相關(guān)。
有利于轉(zhuǎn)錄終止
RNAP沒有3’ →5’外切酶活性,不能進(jìn)行轉(zhuǎn)錄校正。其錯(cuò)配率達(dá)10-4。RNAP倒退暴露新合成的錯(cuò)配堿基,可以有利于其他輔助核酸酶將錯(cuò)配堿基切除,增加轉(zhuǎn)錄的忠實(shí)性。s70基礎(chǔ)啟動(dòng)子的一般結(jié)構(gòu)
-10 序列:它對(duì)轉(zhuǎn)錄起始時(shí),RNAP打開DNA雙鏈的過程非常重要。-
10序列到TSS位點(diǎn)的距離對(duì)轉(zhuǎn)錄效率也有很大的影響-35 序列:增強(qiáng)RNAP s factor 的識(shí)別能力及與DNA的結(jié)合能力 4 影響啟動(dòng)子效率的DNA序列:
核心啟動(dòng)子的序列:與保守序列越像,效率越高。
TSS周圍序列:影響起始效率。
轉(zhuǎn)錄單位的前30個(gè)核苷酸的堿基序列:影響RNAP從啟動(dòng)子處移動(dòng)出去(啟動(dòng)子區(qū)清空)的速率。
核心啟動(dòng)子附近的調(diào)控元件。轉(zhuǎn)錄的起始:開放復(fù)合物 閉合復(fù)合物 無效起始
延伸:?jiǎn)?dòng)子的清空,鏈的延伸轉(zhuǎn)錄泡,s因子的循環(huán)利用
終止:依賴性 不依賴性
反復(fù)重復(fù)序列
Section L 1.順式作用元件(cis-acting elements):一般為DNA上較為保守的、有著特異性序列或結(jié)構(gòu)的特定區(qū)域。它們只能影響與其在同一條染色體上的基因的活動(dòng)。如:?jiǎn)?dòng)子,轉(zhuǎn)錄激活因子結(jié)合位點(diǎn)等。
反式作用基因/調(diào)節(jié)基因(trans-acting genes,regulator genes)
可以影響與他們不在同一條染色體上的基因的表達(dá)水平的DNA元件。2 乳糖操縱子 色氨酸操縱子 正負(fù)調(diào)控都可以有誘導(dǎo)和阻遏兩種調(diào)控方式。
正控誘導(dǎo):誘導(dǎo)因子活化激活因子,使其可以增加基因的表達(dá)。(Lac operon,CRP調(diào)控)正控阻遏:共阻遏物使激活因子失活,減少基因的表達(dá)。負(fù)控誘導(dǎo):誘導(dǎo)因子使阻遏蛋白失活,增加基因的表達(dá)。(Lac operon,lac repressor)負(fù)控阻遏:共阻遏物活化阻遏蛋白,使其可以降低基因的表達(dá)。(Trp operon,trp repressor)
Section M 增強(qiáng)子 沉默子 TFIID:可與多種核心啟動(dòng)子元件或特異性轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合,啟動(dòng)二類轉(zhuǎn)錄預(yù)起始復(fù)合物組裝的通用轉(zhuǎn)錄因子。
TBP(TATA-box binding protein):可識(shí)別并結(jié)合TATA-box TAFII(TBP-associated factor II):TBP關(guān)聯(lián)蛋白,TFIID中與TBP形成復(fù)合體的所有蛋白,~13個(gè)。
TFII H的結(jié)構(gòu)與功能:蛋白激酶(4 個(gè)亞基):催化蛋白磷酸化。將NTP(一般為ATP)的g-磷酸基團(tuán)轉(zhuǎn)移到蛋白上。
磷酸化 RNA pol II 中的CTD 結(jié)構(gòu)域。TFIIE 刺激TFIIH介導(dǎo)的磷酸化反應(yīng)。DNA 解旋酶/ATPase(5 亞基):
水解ATP,利用其能量打開DNA的雙鏈 TBP(TATA-binding protein): 確保 RNA Pol I能正確定位到轉(zhuǎn)錄起始區(qū)域上。
SP1 為組成性表達(dá)的轉(zhuǎn)錄因子,在所有的細(xì)胞中都存在,與基因本底表達(dá)水平有關(guān) SL1,選擇因子,RNA Pol I起始轉(zhuǎn)錄所必需的因子 CTD:羧基末端結(jié)構(gòu)域,的磷酸化狀態(tài)與轉(zhuǎn)錄進(jìn)程有關(guān)
轉(zhuǎn)錄起始時(shí)期,CTD結(jié)構(gòu)域一般處于去磷酸化形式,與結(jié)合啟動(dòng)子有關(guān)。
轉(zhuǎn)錄延伸時(shí)期,CTD結(jié)構(gòu)域常處于磷酸化形式,與mRNA的加工有關(guān)。
Section N 1 DNA-binding domains(DBD):DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域
螺旋-轉(zhuǎn)角-螺旋結(jié)構(gòu)(域)
鋅指結(jié)構(gòu)(域)
堿性結(jié)構(gòu)(域)
Dimerization domains:二聚體化結(jié)構(gòu)域
亮氨酸拉鏈 螺旋 散環(huán) 螺旋 DBD+DM 激活結(jié)構(gòu)域 酸性激活結(jié)構(gòu)域 富含谷氨酰胺結(jié)構(gòu)域 富含脯氨酸的結(jié)構(gòu)域 LBD
Section O 真核生物中mRNA 加工的一般過程 5’加帽: CTD作用:轉(zhuǎn)錄起始時(shí),參與加帽反應(yīng)的三種酶結(jié)合在RNA Pol II的CTD結(jié)構(gòu)域上。轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物剛開始合成時(shí),即對(duì)其5’端進(jìn)行加帽反應(yīng)。
作用:防止降解:核糖核酸酶一般不能降解帽結(jié)構(gòu)中的三磷酸鍵
幫助轉(zhuǎn)運(yùn)mRNA到細(xì)胞質(zhì)中
增強(qiáng)翻譯水平:mRNA需要帽結(jié)合蛋白的幫助才能更好的與核糖體結(jié)合 幫助去除pre-mRNA中的第一個(gè)內(nèi)含子。3’加Poly(A)尾:
作用:防止被核酸酶降解:增加mRNA的穩(wěn)定性
有助于mRNA從細(xì)胞核到細(xì)胞質(zhì)的轉(zhuǎn)運(yùn)
參與pre-mRNA的最后一個(gè)內(nèi)含子的剪接。
增強(qiáng)mRNA的翻譯水平,增加基因的表達(dá) 剪接 甲基化 2 核酶有:有催化功能的RNA即為核酶
U2 U6 RNAP 3 RNA的多樣性:可變加工,反式剪接,RNA編輯 原核生物核糖體
真核生物核糖體 原核rRNA 加工的大致過程:形成多個(gè)莖環(huán)結(jié)構(gòu),與蛋白結(jié)合形成RNP,核苷酸修飾,逐級(jí)切割
真核rRNA 加工的大致過程:甲基化,切割。內(nèi)含子剪接 原核tRNA 加工的大致過程:將多順反子前體切割,分離出單順反子前體
單順反子前體進(jìn)一步被切割,形成與成熟tRNA長度一致分子(RNases D, E, F,P
.堿基修飾,形成成熟tRNA 真核tRNA 加工的大致過程:5’-末端成熟,3’-末端成熟(添加5’-CCA-3’)去除內(nèi)含子 7 miRNA and siRNA的調(diào)控機(jī)制:mRNA降解,抑制翻譯,抑制轉(zhuǎn)錄
Section P 1 遺傳密碼的特性:
蛋白的編碼信息由三聯(lián)體密碼子組成。
密碼子為連續(xù)的,之間無間隔、無重疊。
除三個(gè)終止密碼子之外,每個(gè)密碼子對(duì)應(yīng)一種氨基酸
有密碼簡(jiǎn)并現(xiàn)象。即:多個(gè)密碼子對(duì)應(yīng)同一種氨基酸。
標(biāo)準(zhǔn)遺傳密碼子在各類生物中基本通用,不過少數(shù)生物體或細(xì)胞器中,有一些密碼子對(duì)應(yīng)的氨基酸與標(biāo)準(zhǔn)的不同。
生物對(duì)同義密碼子的使用經(jīng)常有偏好性。不同生物的密碼子偏好性不同。
基因一般不重疊。一段核酸分子一般只有一個(gè)開放閱讀框(open reading frame, ORF/可讀框),被翻譯成一個(gè)蛋白。
有些物種也有重疊基因的現(xiàn)象。開放閱讀框:ORF 從起始密碼子ATG 到終止密碼子
TGA,TAA or TAG 之間的連續(xù)的蛋白編碼序列
CDS 編碼序列 當(dāng)ORF可以預(yù)測(cè)一個(gè)蛋白時(shí) 3 tRNA 二級(jí)結(jié)構(gòu):三葉草結(jié)構(gòu) 4 tRNA的特異性加載:(翻譯的高保真性)
氨酰-tRNA合成酶對(duì)相應(yīng)tRNA分子有很強(qiáng)的專一性:第二密碼子:
氨酰-tRNA合成酶接受相應(yīng)氨基酸時(shí)有很強(qiáng)的忠實(shí)性:校正:雙篩選機(jī)制—酶的活性中心,酶中的編輯位點(diǎn) 氨酰-tRNA(AA-tRNA): 3’-end加載了一個(gè)氨基酸的tRNA分子。是在蛋白質(zhì)合成中,將密碼子轉(zhuǎn)換氨基酸的適配器。
Section Q 1 密碼子與反密碼子的反向互補(bǔ)配對(duì) 一個(gè)tRNA可識(shí)別的密碼子數(shù)由反密碼子的第一位堿基決定
擺動(dòng)學(xué)說:第三位密碼子與第一位反密碼子的配對(duì)可以擺動(dòng)
反密碼子第一位為A或C時(shí),配對(duì)無搖擺現(xiàn)象。3 核糖體的E,P,A位點(diǎn) A位:接受AA-tRNA部位.除了起始氨酰-tRNA,其他所有AA-tRNA都只能進(jìn)A位點(diǎn)。P位:肽?;?tRNA結(jié)合部位。起始氨酰-tRNA也進(jìn)入此位點(diǎn)。E位:空載tRNA離開核糖體的位點(diǎn)。4 核糖體各亞基的功能
核糖體小亞基功能:結(jié)合mRNA
促進(jìn)密碼子與反密碼子的正確結(jié)合 mRNA移位
大亞基的功能A位、P位、肽酰轉(zhuǎn)移酶(轉(zhuǎn)肽酶)中心等在大亞基上。
負(fù)責(zé)攜帶AA-tRNA、肽鍵/肽鏈的形成 5 翻譯的基本內(nèi)容 核糖體與mRNA結(jié)合
氨酰tRNA逐個(gè)進(jìn)入核糖體
氨酰tRNA通過反密碼子與mRNA互補(bǔ)配對(duì) 氨酰tRNA分子的氨基酸之間形成肽鍵。空載tRNA的釋放 肽鏈的釋放
第二篇:現(xiàn)代分子生物學(xué)總結(jié)
醫(yī)學(xué)細(xì)胞與分子生物學(xué)習(xí)題庫
一、名詞解釋
1.基因組
2.基因文庫
3.衛(wèi)星DNA
4.SD序列
5.分子克隆
6.載體
7.反式作用因子
8.粘性末端
9.限制性內(nèi)切酶
10.cDNA文庫
11.轉(zhuǎn)化率
12.質(zhì)粒拷貝數(shù)
13.體外重組
14.感受態(tài)細(xì)胞
15.探針
16.核酸雜交
17.陽性克隆
18.固相雜交
19.解鏈溫度
20.C值悖理
21.基因家簇
22.反義RNA
23.RNA干擾
24.魔斑
25.順式作用元件
二.填空題
1.真核生物基因組DNA序列可分為()、()和()。
2.真核生物基因組高度重復(fù)序列包括()、()、()和()四種。
5.原核生物轉(zhuǎn)錄水平調(diào)控的方式有()和()兩種方式;前者又可分為()和();后者可分為()和()。
6.真核生物基因表達(dá)調(diào)控包括()、()、()、()和()五個(gè)層次。
7.真核生物基因組DNA水平的調(diào)控包括()、()、()、()和()五種方式。
8.反式作用因子可劃分為()、()和()三類。
12.影響雜交的因素有()、()、()、()和()。
15.逆轉(zhuǎn)錄酶是多功能酶,具有()、()、()三種功能,但無()作用。
16.DN的損傷突變類型有()、()、()、()和()。
17.引起DNA損傷突變的因素是()、()、()、()和()。
18.DNA的損傷修復(fù)方式有()、()、()和()。
20.病毒基因組可由()或()組成;細(xì)菌基因組由一條()組成;真核生物基因組由()和()形成()。
21.原核生物基因表達(dá)調(diào)控的方式有()和();其中()是主要的方式。
22.、操縱子由()、()和()組成;受()產(chǎn)物的調(diào)控。
23.順式作用元件按功能可劃分為()、()、()和()。
24.分子克隆技術(shù)的操作包括()、()、()和()等四個(gè)基本過程。
25.限制性內(nèi)切酶分為()、()、()三種,其中只
有()在基因工程操作中被應(yīng)用。
26.限制性內(nèi)切酶識(shí)別()序列; DNA分子在該酶切割下可產(chǎn)生()、()或()末端。
27.分子克隆中常用的工具酶有()、()、()和()。
28.分子克隆中常用的載體有()、()、()和()。
29.目的基因制備的常用方法有()、()、()。
30.體外重組常用方法有()、()、()和()。
31.重組體導(dǎo)入原核生物細(xì)胞中的常用方法有()和();重組體導(dǎo)入真核生物細(xì)胞中的常用方法有()、()和()。
32.重組體的篩選方法有()、()、()、()。
33.cDNA文庫的構(gòu)建步驟是()、()()、()。
34.常用的核酸探針包括()、()和()。
35.放射性同位素標(biāo)記常用的標(biāo)記方法有()、()、()。
36.分子克隆中常用的非放射性同位素標(biāo)記物有()、()、()等;常用的標(biāo)記方法有()、()。
37.核酸雜交技術(shù)可分為()和()兩種類型;后者又可分為()和()。
39.PCR技術(shù)的基本過程是()、()、()。
40.影響PCR的因素有()、()、()、()、()。
41.PCR反應(yīng)的特點(diǎn)是()、()、()、()。
45.限制性核酸內(nèi)切酶的作用特點(diǎn)是()、()、()、()。
50.DNA切除修復(fù)需要的酶有()、()和()。
三、判斷題
1、生物越高度,基因組越龐大,基因數(shù)目就越多。()
2、真核生物結(jié)構(gòu)基因都是單拷貝,rRNA基因?yàn)槎嗫截?。(?/p>
3、同基因是一類結(jié)構(gòu)上完全相同,表達(dá)產(chǎn)物功能也相同的一組基因。()
4、真核細(xì)胞基因轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物為單順反子。()
5、原核細(xì)胞基因轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物為多順反子。()
6、真核生物基因組中不編碼的區(qū)域多于編碼的區(qū)域。()
7、衛(wèi)星DNA實(shí)際上是出現(xiàn)在非編碼區(qū)的串聯(lián)重復(fù)序列。
8、串聯(lián)重復(fù)序列是形成衛(wèi)星DNA 的基礎(chǔ)。
9、所有真核生物基因組中都有α衛(wèi)星DNA。
10、高度重復(fù)序列在真核生物細(xì)胞基因組中重復(fù)出現(xiàn)可達(dá)106次以上。
11、中度重復(fù)序列的長度和拷貝數(shù)很不均一。
12、短分散片段重復(fù)順序的平均長度約為3500-5000bp。
13、長分散片段重復(fù)順序的平均長度約為300bp。
14、中度重復(fù)序列大多不編碼蛋白質(zhì)。
15、高度重復(fù)序列中有一些可編碼蛋白質(zhì)。
16、中度重復(fù)順序一般具有種特異性。
17、每種組蛋白的基因在同一種生物中拷貝數(shù)是相同的。
18、不同生物中組蛋白基因在基因組中的排列不一樣。
19、端粒是所有生物染色體末端的一種特殊結(jié)構(gòu)。
20、以RNA為模版合成出的DNA鏈叫負(fù)股鏈。
21、顛換是指原為嘧啶突變后變?yōu)猷堰省?/p>
22、置換是指原為嘧啶突變后變?yōu)猷堰省?/p>
23、重組修復(fù)也叫復(fù)制后的修復(fù)。
24、原核細(xì)胞和真核細(xì)胞中許多mRNA都是多順反子轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物。
25、限制性內(nèi)切酶切割的DNA片段都具有粘性末端。
26、原核生物中mRNA一般不需要轉(zhuǎn)錄后加工。
27、增強(qiáng)子并沒有啟動(dòng)子活性,卻具有增強(qiáng)啟動(dòng)子活性,促進(jìn)轉(zhuǎn)錄起始的效能。
28、在雙向復(fù)制中一條鏈按5′→3′的方向合成,另一條鏈按3′→5′的方向合成。
29、原核細(xì)胞和真核細(xì)胞復(fù)制在多個(gè)位點(diǎn)同時(shí)起始進(jìn)行。
30、真核細(xì)胞的基因是不連續(xù)的,轉(zhuǎn)錄出來的所有RNA都必須經(jīng)過加工。(31、生物DNA分子的大小等于基因的總和。()
32、所有多肽鏈經(jīng)核糖體翻譯出來即有正常生理功能。
33、核糖體是蛋白質(zhì)和rRNA構(gòu)成的功能復(fù)合體。
34、機(jī)體的各種細(xì)胞中含有相同的遺傳信息,所以有相同的表達(dá),35、在負(fù)控誘導(dǎo)系統(tǒng)中,阻遏蛋白不與效應(yīng)物結(jié)合時(shí),結(jié)構(gòu)基因不轉(zhuǎn)錄。
36、在負(fù)控阻遏系統(tǒng)中,阻遏蛋白不與效應(yīng)物結(jié)合時(shí),結(jié)構(gòu)基因不轉(zhuǎn)錄。
37、CAP結(jié)合在啟動(dòng)子上時(shí),能促進(jìn)RNA聚合酶與啟動(dòng)子結(jié)合,促進(jìn)轉(zhuǎn)錄。)
38、CAP首先與cAMP形成復(fù)合物才能與啟動(dòng)子結(jié)合。
39、RBS是指mRNA起始密碼AUG前的一段非翻譯區(qū)。
40、反義RNA由反義基因轉(zhuǎn)錄而來。
41、轉(zhuǎn)錄后基因沉默被稱為RNAi。
42、細(xì)胞中蛋白質(zhì)合成旺盛時(shí),mRNA鏈上核糖體數(shù)量就多,poly(A)也較長。
43、限制性核酸內(nèi)切酶是原核生物所特有的酶。
44、只有Ⅱ型限制性核酸內(nèi)切酶在分子生物學(xué)中被應(yīng)用。
45、COS區(qū)是指λ噬菌體粘性末端構(gòu)成的區(qū)域。
53、基因擴(kuò)增是指某些基因的拷貝數(shù)大量增加的現(xiàn)象。
54、基因重排是DNA水平調(diào)控的重要方式之一
55、所有核酸的合成都是以堿基配對(duì)為基礎(chǔ)的。
56、甲基化程度與基因的表達(dá)一般呈反比關(guān)系。
57、基因的甲基化程度愈高,其表達(dá)則降低。
58、去除組蛋白基因轉(zhuǎn)錄活性降低。
59、常染色質(zhì):結(jié)構(gòu)松散,基因不表達(dá)。
60、異染色質(zhì):結(jié)構(gòu)緊密,基因表達(dá)。
61、有基因表達(dá)活性的染色質(zhì)DNA對(duì)DNaseⅠ更敏感。
62、真核生物基因調(diào)控主要也是在轉(zhuǎn)錄水平上進(jìn)行的。
四、選擇題:
1.原核生物基因組中的復(fù)制起始點(diǎn)有()
A.1個(gè)B.2個(gè)C.多個(gè)D.1000個(gè)以上
2.真核生物基因組中的復(fù)制起始點(diǎn)有()
A.1個(gè)B.2個(gè)C.多個(gè)D.1000個(gè)以上
3.真核生物基因之間的間隔區(qū)與基因組大?。ǎ?/p>
A.有關(guān)B.無關(guān)C.成正比E.成反比
4.衛(wèi)星DNA的長度一般為()
A.5-10bpB.300bpC.100bpD.500-1000bp
5.在大腸桿菌細(xì)胞中DNA復(fù)制的保真性主要是下列哪個(gè)酶的作用(A.DNA聚合酶ⅠB.DNA聚合酶Ⅱ
C.DNA聚合酶ⅢD.DNA連接酶
6.既有內(nèi)切酶活力,又有連接酶活力的是
A.拓?fù)洚悩?gòu)酶B.DNA聚合酶Ⅱ
C.解螺旋酶D.DNA連接酶)
7.轉(zhuǎn)錄過程中遺傳信息的轉(zhuǎn)遞方向是()
A.DNA→RNAB.RNA→DNAC.DNA→DNAD.RNA→RNA
8.hnRNA是()
A.存在于細(xì)胞核內(nèi)的tRNA前體B.存在于細(xì)胞核內(nèi)的mRNA前體
C.存在于細(xì)胞核內(nèi)的rRNA前體D.存在于細(xì)胞核內(nèi)的snRNA前體
9.以RNA為模板合成DNA的酶是()
A.DNA聚合酶ⅢB.DNA聚合酶ⅠC.RNA聚合酶D.反轉(zhuǎn)錄酶
10.蛋白質(zhì)的生物合成中肽鏈延伸方向是()
A.5→3B.從N端到C端C.3→5D.從C端到N端,,11.蛋白質(zhì)翻譯后的加工主要包括()。
A.氨基酸側(cè)鏈修飾B.水解修飾
C.二硫鍵的形成D. 上述各種修飾都包括
12.操縱子調(diào)控系統(tǒng)屬于哪一種水平的調(diào)控()
A.復(fù)制水平的調(diào)節(jié)B。轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)節(jié)
C.翻譯水平的調(diào)節(jié)D。轉(zhuǎn)錄后加工的調(diào)控
13.與乳糖操縱子操縱基因結(jié)合的物質(zhì)是()
A.RNA聚合酶B.DNA聚合酶C.阻遏蛋白D.誘導(dǎo)物
14、參與線粒體DNA復(fù)制的酶是()
A.polαB.polδC.polβD.polγ
15、參與領(lǐng)頭鏈DNA復(fù)制的酶是()
A.polαB.polδC.polβD.polγ
16、端粒酶是一種()
A.逆轉(zhuǎn)錄酶B.RNA聚合酶C.DNA聚合酶D.DNA酶
17.含稀有堿基最多的RNA是()
A.mRNAB、rRNAC.5S-rRNAD.tRNA
18.大腸桿菌DNA連接酶需要下列哪一種輔助因子?()
A.FAD作為電子受體B.NADP+作為磷酸供體
C.NAD+形成活性腺苷酰酶D.NAD+作為電子受體
19.真核生物RNA聚合酶I催化轉(zhuǎn)錄的產(chǎn)物是()
A.mRNAB.45S-rRNAC.5S-rRNAD.tRNA
20.魔斑是指()
A.ppGppB.cAMPC.cGMPD.7mGppp
21.CAP復(fù)合體與操縱子結(jié)合的部位是()
A.啟動(dòng)子B.操縱基因C.結(jié)構(gòu)基因D.調(diào)節(jié)基因
22.基因的甲基化修飾一般發(fā)生在()
A.CpGB.ApGC.GpTD.TpG
23.有基因表達(dá)活性的染色質(zhì)DNA對(duì)下列那個(gè)酶敏感性增加?()
A.DNaseⅠB.DNA polⅠC.DNA polⅡD.Rnase H
24.真核生物的RNA聚合酶識(shí)別的是()
A.啟動(dòng)子B.增強(qiáng)子C.TF-DNA復(fù)合體D.RF
25.在分子生物學(xué)中被應(yīng)用的限制性核酸內(nèi)切酶是()
A.Ⅰ型B.Ⅱ型C.Ⅲ型D.以上都沒用
26.限制性核酸內(nèi)切酶錯(cuò)位切割產(chǎn)生()
A.粘性末端B.平頭末端C.3’-磷酸D.5’-羥基
27.大腸桿菌DNA連接酶只能連接()
A.粘性末端B.平頭末端C.3’-磷酸D.5’-羥基
28.pBR322是()
A.復(fù)制型載體B.表達(dá)型載體C.穿梭載體D.噬菌體載體
29、pUC載體是()
A.復(fù)制型載體B.表達(dá)型載體C.穿梭載體D.噬菌體載體
30.M13噬菌體是()
A.單鏈DNA噬菌體B.雙鏈DNA噬菌體
C.RNA噬菌體D.都不是
31、B.表達(dá)型載體C.穿梭載體D.噬菌體載體
五.問答題
1.分子克隆中常用的工具酶有哪些?各有何用途?
2.何謂載體?分子克隆中常用的載體有哪些?理想的載體應(yīng)具備哪些條件?
3.何謂PCR?試述PCR基本技術(shù)原理和影響因素。
4.常用的核酸探針有哪些類型?各有何優(yōu)缺點(diǎn)?
5.將目的DNA與載體DNA連接起來的方法有哪些?并用文或圖表示各種連接過程。
6.簡(jiǎn)述原核生物與真核生物基因組結(jié)構(gòu)特點(diǎn)。
9.體外重組常用的連接方法有哪些?各有何優(yōu)缺點(diǎn)?
13.何謂核酸雜交?常用的雜交方法有哪些?
28.何謂宿主細(xì)胞?分子克隆中常用的宿主細(xì)胞有哪些?宿主細(xì)胞應(yīng)具備哪些條件?
31.簡(jiǎn)述重組體導(dǎo)入哺乳動(dòng)物細(xì)胞的方法
35、DNA損傷修復(fù)有哪些類型?試述各類型的修復(fù)方式。
第三篇:分子生物學(xué)復(fù)習(xí)總結(jié)
分子生物學(xué)
一.緒論
1.分子生物學(xué)研究的主要內(nèi)容包括:1)DNA重組技術(shù);2)基因表達(dá)調(diào)控的研究;3)生物大分子的結(jié)構(gòu)功能研究;4)基因組、功能基因組與生物信息學(xué)研究。P11
2.分子生物學(xué)研究的三大理論和兩大技術(shù)保證 :1)40年代確定了遺傳信息的攜帶者,即基因的分子載體是DNA而不是蛋白質(zhì),解決了遺傳的物質(zhì)基礎(chǔ)問題;2)50年代提出了DNA分子的雙螺旋結(jié)構(gòu)模型和半保留復(fù)制機(jī)制,解決了基因的自我復(fù)制和世代交替問題;3)50年代末至60年代,相繼提出了“中心法則”和操縱子學(xué)說,成功地破譯了遺傳密碼,充分認(rèn)識(shí)了遺傳信息的流動(dòng)和表達(dá)。兩大技術(shù)保證:1)DNA的體外切割和連接;2)DNA的核苷酸序列分析技術(shù)。
二.染色體與DNA
3.核小體是由H2A、H2B、H3、H4各兩個(gè)分子生成的八聚體和由大約200bpDNA組成的。八聚體在中間,DNA分子盤繞在外,而H1則是在核小體的外面。每個(gè)核小體只有一個(gè)H1。核小體的形成是染色體中DNA壓縮的第一個(gè)階段。
4.原核生物DNA的主要特征:1)原核生物中一般只有一條染色體,且大都帶有單拷貝基因,只有少數(shù)基因(如rRNA基因)是以多拷貝形式存在的;2)整個(gè)染色體DNA幾乎全部由功能基因與調(diào)控序列所組成;3)幾乎每個(gè)基因序列都與它所編碼的蛋白質(zhì)序列成線性對(duì)應(yīng)狀態(tài)。
5.真核細(xì)胞染色體具有如下特征:1)分子結(jié)構(gòu)相對(duì)穩(wěn)定;2)能夠自我復(fù)制,使親、子代之間保持連續(xù)性;3)能夠指導(dǎo)蛋白質(zhì)的合成,從而控制整個(gè)生命過程;4)能夠產(chǎn)生可遺傳的變異。
6.染色體上的蛋白質(zhì)包括組蛋白和非組蛋白。組蛋白是染色體的結(jié)構(gòu)蛋白,它與DNA形成核小體。
7.組蛋白具有如下特性:1)進(jìn)化上的極端保守性;2)無組織特異性;3)肽鏈上氨基酸分布的不對(duì)稱性,堿性氨基酸集中分布在N端的半條鏈上;4)組蛋白的修飾作用,包括甲基化、乙?;?、磷酸化及ADP核糖基化等;5)富含賴氨酸的組蛋白H5,H5的磷酸化在蛋白質(zhì)的失活過程中起重要作用。
8.非組蛋白有:HMG蛋白、DNA結(jié)合蛋白、H24非組蛋白。
9.C值反常現(xiàn)象:真核細(xì)胞基因組的最大特點(diǎn)是它含有大量的重復(fù)序列,而且功能DNA序列大多被不編碼的蛋白質(zhì)的非功能DNA所隔開。所謂C值,通常是指一種是生物體單倍體基因組DNA的總量。
10.DNA的二級(jí)結(jié)構(gòu):是指兩條多核苷酸反向平行盤繞所生成的雙螺旋結(jié)構(gòu)。二級(jí)結(jié)構(gòu)的分類,右手螺旋:A-DNA和B-DNA;右手螺旋:Z-DNA。
11.DNA的半保留復(fù)制機(jī)制:DNA在復(fù)制過程中堿基間的氫鍵首先斷裂,雙螺旋被分開,每條鏈分別作為模板合成新鏈,產(chǎn)生互補(bǔ)的兩條鏈。這樣新形成的兩個(gè)DNA分子與原來DNA分子的堿基順序完全一樣。因此,每個(gè)子代分子的一條鏈來自親代DNA,另一條鏈則是新合成的,所以這種復(fù)制方式被稱為DNA半保留復(fù)制。
12.真核生物DNA的復(fù)制與原核生物DNA復(fù)制的區(qū)別:1)真核生物每條染色體上可以有多處復(fù)制起點(diǎn),而原核生物只有一個(gè)復(fù)制起點(diǎn);2)真核生物的染色體在全部完成復(fù)制之前,各個(gè)起始點(diǎn)上DNA的復(fù)制不能再開始,而在快速生長的原核生物中,復(fù)制起始點(diǎn)上可以連續(xù)開始新的DNA復(fù)制,表現(xiàn)為雖只有一個(gè)復(fù)制單元,但可以有多個(gè)復(fù)制叉。
13.原核細(xì)胞染色體DNA復(fù)制的功能單位是復(fù)制子,由起始物位點(diǎn)和復(fù)制起點(diǎn)兩個(gè)部分組成。起始物位點(diǎn)編碼復(fù)制調(diào)節(jié)蛋白質(zhì),復(fù)制起點(diǎn)與蛋白質(zhì)相互作用并啟動(dòng)復(fù)制。
14.錯(cuò)配修復(fù)系統(tǒng)修復(fù)的原則是“保存母鏈,修復(fù)子鏈”,找出錯(cuò)誤堿基所在的DNA鏈,進(jìn)行修復(fù)。
15.轉(zhuǎn)座子是存在于染色體DNA上可自主復(fù)制和移位的基本單位。可分為:IS序列、復(fù)合式轉(zhuǎn)座子、Tna家族。
三、生物信息的傳遞(上)從DNA到RNA
16.DNA是儲(chǔ)藏遺傳信息的最重要的生物大分子,DNA雙鏈可以分為:編碼鏈和模板鏈。
17.轉(zhuǎn)錄的基本過程:模板識(shí)別、轉(zhuǎn)錄起始、通過啟動(dòng)子及轉(zhuǎn)錄的延伸和終止。
18.?因子的作用:使RNA聚合酶全酶識(shí)別啟動(dòng)子序列的特異性總共提高了107倍。
19.轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物:當(dāng)新生RNA鏈達(dá)到6-9個(gè)核苷酸使才能形成穩(wěn)定的RNA聚合酶-DNA-RNA三元復(fù)合物,釋放?因子,表示轉(zhuǎn)錄起始的終止,轉(zhuǎn)錄進(jìn)入延伸期。,20.啟動(dòng)子是一段位于結(jié)構(gòu)基因5端上游區(qū)的DNA序列,能活化RNA聚合酶,使之與模板
DNA準(zhǔn)確地相結(jié)合并具有轉(zhuǎn)錄起始的特異性。啟動(dòng)子結(jié)構(gòu):1)轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn);2)-10區(qū)(TATA區(qū));3)-35區(qū)(TTGACA區(qū))。
21.原核生物DNA的-10區(qū)與-35區(qū)的距離為16-19bp時(shí),能夠維持啟動(dòng)子的活性。另外,增強(qiáng)子也具有強(qiáng)化轉(zhuǎn)錄起始的作用。
22.真核生物啟動(dòng)子區(qū)包括:TATA區(qū)、CAAT區(qū)、GC區(qū)、增強(qiáng)子,習(xí)慣上將TATA區(qū)上游的保守序列稱為上游啟動(dòng)子元件或上游激活序列。
23.原核生物mRNA與真核生物mRNA的特征比較:
原核生物mRNA的特征:1)原核生物mRNA的半衰期短;2)許多原核生物mRNA以多順,反子的形式存在;3)原核生物mRNA的5端無帽子結(jié)構(gòu),3端沒有或只有較短的poly(A)
結(jié)構(gòu)。,真核生物mRNA的特征:1)真核生物mRNA的5端存在帽子結(jié)構(gòu);2)絕大多數(shù)真核生物
mRNA具有poly(A)尾巴。
四、生物信息的傳遞(下)mRNA-蛋白質(zhì)
24.三聯(lián)子密碼:mRNA上每3個(gè)核苷酸翻譯成蛋白質(zhì)多肽鏈上的一個(gè)氨基酸,這三個(gè)核苷酸就稱為密碼,也叫三聯(lián)子密碼。
25.移碼突變:在開放閱讀框內(nèi)插入非3的倍數(shù)的密碼子引起的突變叫做移碼突變。
26.密碼子的簡(jiǎn)并性:由一種以上密碼子編碼同一種氨基酸的現(xiàn)象稱為密碼子的簡(jiǎn)并性,對(duì)應(yīng)于同一種氨基酸的密碼子稱為同義密碼子。
27.rRNA的三葉草型二級(jí)結(jié)構(gòu),由受體臂、TΨC臂、多余臂、反密碼子臂、D臂組成,其中最重要的兩條臂是受體臂和反密碼子臂。
28.核糖體由大、小兩個(gè)亞基組成,小亞基組要負(fù)責(zé)對(duì)模板mRNA進(jìn)行特異性識(shí)別,mRNA的結(jié)合位點(diǎn)也在小亞基上;大亞基負(fù)責(zé)攜帶氨基酸及tRNA的功能,肽鍵的形成,AA-tRNA、肽基-tRNA的結(jié)合等,A位、P位、轉(zhuǎn)肽酶中心等主要在大亞基上。
29.蛋白質(zhì)合成的生物學(xué)機(jī)制。大致步驟:氨基酸的活化,肽鏈的起始,肽鏈的延伸,肽鏈的終止及釋放,肽鏈的折疊和加工。
A.氨基酸的活化:氨基酸在氨酰-tRNA合成酶的作用下生成活化氨基酸:AA-tRNA。(原核
fMetMet生物首先被活化的是fMet-tRNA,真核生物則是Met-tRNA)
B.翻譯的起始:(IF因子的參與)核糖體上三個(gè)與氨酰-tRNA結(jié)合的位點(diǎn):A位、P位、E位。在原核細(xì)胞核糖體翻譯起始時(shí),只有fMet-tRNAfMet能與第一個(gè)P位點(diǎn)結(jié)合,其他所有tRNA都必須通過A位到達(dá)P位,再由E位離開核糖體。
C.肽鏈的延伸:包括后續(xù)AA-rRNA與核糖體結(jié)合、肽鍵的生長、移位三個(gè)步驟。
D.肽鏈的終止:RF與終止密碼子相結(jié)合后,誘導(dǎo)肽基轉(zhuǎn)移酶把一個(gè)水分子而不是氨基酸加到延伸中的肽鏈上,水解P位上與多肽鏈與tRNA之間的二脂鍵。
E.蛋白質(zhì)的前體加工:包括N端fMet或Met切除,二硫鍵的形成,特定氨基酸的修飾,切除新生肽鏈中非功能片段。
30.信號(hào)肽的結(jié)構(gòu)特點(diǎn):1)一般帶有10-15個(gè)疏水氨基酸;2)在靠近該序列N端常常有1個(gè)或數(shù)個(gè)帶正電荷的氨基酸;3)在其C-末端靠近蛋白酶切割位點(diǎn)處常常帶有數(shù)個(gè)極性氨基酸,離切割位點(diǎn)最近的那個(gè)氨基酸往往帶有很短的側(cè)鏈(丙氨酸或甘氨酸)。
31.信號(hào)肽假說:1)完整的信號(hào)肽是保證蛋白質(zhì)運(yùn)轉(zhuǎn)的必要條件;2)僅有信號(hào)肽還不足以保證蛋白質(zhì)運(yùn)轉(zhuǎn)的發(fā)生;3)信號(hào)序列的切除并不是運(yùn)轉(zhuǎn)所必需的;4)并非所有的轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白質(zhì)都有可降解的信號(hào)肽。
32.信號(hào)肽的定義:能啟動(dòng)蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)的任何一段多肽。
33.前導(dǎo)肽對(duì)線粒體蛋白質(zhì)的識(shí)別和跨膜有關(guān)鍵作用。
34.前導(dǎo)肽的結(jié)構(gòu)和功能:1)前導(dǎo)肽通常是疏水的;2)帶正電荷的堿性氨基酸(特別是精氨酸)含量較為豐富,它們分散于不帶電荷的氨基酸序列之間;3)羥基氨基酸(特別是絲氨酸)含量較高;4)有形成兩親α-螺旋結(jié)構(gòu)的能力;5)帶正電荷的堿性氨基酸在前導(dǎo)肽中有重要作用,如果它們被不帶電荷的氨基酸所取代,就不能發(fā)揮牽引蛋白質(zhì)的過膜的作用。
五、分子生物學(xué)研究方法:
35.電泳:指帶電粒子在電場(chǎng)中向與自身電荷相反的電荷的電極移動(dòng)的現(xiàn)象。
36.遷移率:電泳分子在電場(chǎng)作用下遷移的速度,它與電場(chǎng)強(qiáng)度和電泳分子本身攜帶的凈電荷成正比,與分子的摩擦系數(shù)成反比。
37.分子雜交:標(biāo)記的探針DNA變性后與變性后的靶DNA/RNA通過堿基互補(bǔ)配對(duì)結(jié)合,形成雜種分子的過程。
38.核酸探針:是指能與特定核苷酸序列發(fā)生特異性互補(bǔ)的已知核苷酸片段,因而可檢測(cè)樣品中特定的基因序列。
39.聚合酶鏈?zhǔn)椒从?PCR)技術(shù)
原理:將雙鏈DNA分子在臨近沸點(diǎn)的溫度下加熱分離成兩條單鏈DNA分子,DNA聚合酶以單鏈DNA作為模板并利用反應(yīng)混合物中的四種脫氧核苷三磷酸合成新生的DNA互補(bǔ)鏈。PCR三步曲:DNA解鏈(變性,90-95℃);引物與模板DNA相結(jié)合(退火,45-55℃);DNA合成(延伸,72℃左右)。
2+PCR反應(yīng)應(yīng)加入:模板DNA、PCR引物、四種核苷酸及適當(dāng)濃度的Mg。
40.瓊脂糖凝膠電泳和聚丙烯酰胺凝膠電泳的區(qū)別:
1)前者是水平電泳,后者是垂直電泳;2)前者為DNA本身的電荷,后者為SDS復(fù)合后的電荷;3)前者為EB染色,后者為考馬斯亮藍(lán)染色。
41.DNA序列分析:Sanger雙脫氧終止法。
六、基因的表達(dá)調(diào)控(上)
42.組成型合成蛋白質(zhì):合成速率不受環(huán)境變化或代謝狀態(tài)影響的蛋白質(zhì)。與之對(duì)應(yīng)的是適應(yīng)型或調(diào)解型蛋白質(zhì)。
43.順式作用元件(DNA上)與反式作用因子(蛋白質(zhì)上)
順式作用元件:是指對(duì)基因表達(dá)有調(diào)節(jié)活性的DNA序列,其活性只影響其自身處在同一個(gè)DNA
分子上的基因,同時(shí),DNA序列通常不編碼蛋白質(zhì),多位于基因旁側(cè)內(nèi)含子
中,如增強(qiáng)子。
反式作用因子:是能調(diào)節(jié)與它們接觸的基因表達(dá)的擴(kuò)散分子(通常是蛋白質(zhì)),如轉(zhuǎn)錄子;
其編碼基因與其識(shí)別或結(jié)合的靶核苷酸序列不在同一個(gè)DNA分子上。
44.原核基因調(diào)控機(jī)制的類型:負(fù)控誘導(dǎo)和負(fù)控阻遏,其調(diào)節(jié)產(chǎn)物是阻遏蛋白;正控誘導(dǎo)和
正控阻遏,其調(diào)節(jié)產(chǎn)物是激活蛋白。
45.通過代謝物調(diào)節(jié)的基因活性主要有可誘導(dǎo)和可阻遏兩大類。
可誘導(dǎo)調(diào)節(jié):是指一些基因在特殊的誘導(dǎo)物或化合物的作用下,由原來關(guān)閉的狀態(tài)轉(zhuǎn)變?yōu)楣?/p>
作狀態(tài)即在某些物質(zhì)的誘導(dǎo)下使基因活化,如大腸桿菌的乳糖操縱子。
可阻遏調(diào)節(jié):這類基因平時(shí)都是開啟的,處在生產(chǎn)蛋白質(zhì)或酶的工作過程中,由于一些特殊
代謝物或化合物的積累而將其關(guān)閉,阻遏了基因的表達(dá)。
46.弱化子:當(dāng)操縱子被阻遏,RNA合成被終止時(shí),起終止轉(zhuǎn)錄信號(hào)作用的那一段核苷酸被
稱為弱化子。
47.葡萄糖效應(yīng)(降解物的抑制作用):指當(dāng)葡萄糖和其他糖類一起作為細(xì)菌的碳源時(shí)葡萄糖總是優(yōu)先被利用,葡萄糖的存在阻止了其他糖類的利用的現(xiàn)象。
48.轉(zhuǎn)錄因子:是轉(zhuǎn)錄起始過程中,RNA聚合酶所需要的輔因子,它是能參與正調(diào)控的反式
作用因子。
49.乳糖操縱子包括三個(gè)結(jié)構(gòu)基因:Z、Y和A,以及啟動(dòng)子、控制子和阻遏子等。
50.Lac操縱子的控制模型:
1)Z、Y、A基因的產(chǎn)物由一條多順反子的mRNA分子所編碼;
2)該mRNA分子的啟動(dòng)區(qū)(P)位于阻遏基因(I)與操縱區(qū)(O)之間,不能單獨(dú)起始半乳糖苷酶和透過酶基因的高效表達(dá);
3)操縱區(qū)是DNA上的一小段序列(僅為26bp),是阻遏物的結(jié)合位點(diǎn);
4)當(dāng)阻遏物與操縱區(qū)相結(jié)合時(shí),lac mRNA的轉(zhuǎn)錄起始受到抑制;
5)誘導(dǎo)物通過與阻遏物結(jié)合,改變它的三維構(gòu)象,使之不能與操縱區(qū)相結(jié)合,從而激發(fā)lac mRNA的合成。
51.Lac操縱子的誘導(dǎo)物:異乳糖,異丙基巰基半乳糖苷(IPTG),巰甲基半乳糖苷(TMG)。
52.Trp操縱子的負(fù)控阻遏系統(tǒng):trpR基因突變常常引起trp mRNA的組成型合成,該基因產(chǎn)物因此被稱為輔阻遏蛋白。當(dāng)培養(yǎng)基中的色氨酸含量較高時(shí),它與游離的輔阻遏蛋白相結(jié)合,并使之與操縱區(qū)DNA緊密結(jié)合;當(dāng)培養(yǎng)基中色氨酸供應(yīng)不足時(shí),輔阻遏物失去色氨酸并從操縱區(qū)上解離,trp操縱子去阻遏。
53.trp操縱子的弱化作用:前導(dǎo)肽基因中有兩個(gè)相鄰的色氨酸密碼子,所以這個(gè)前導(dǎo)肽的翻譯必定對(duì)tRNATrp十分敏感。1)當(dāng)培養(yǎng)基中色氨酸的濃度很低時(shí),負(fù)載有色氨酸的tRNATrp也就少,這樣翻譯通過兩個(gè)相鄰的色氨酸密碼子的速度就會(huì)很慢,當(dāng)4區(qū)被轉(zhuǎn)錄完成時(shí),核糖體才進(jìn)行到1區(qū)(或停留在兩個(gè)相鄰的Trp密碼子處),這時(shí)的前導(dǎo)區(qū)結(jié)構(gòu)是2-3配對(duì),不形成3-4配對(duì)的終止結(jié)構(gòu),所以轉(zhuǎn)錄可以繼續(xù)進(jìn)行,直到將trp操縱子中的結(jié)構(gòu)基因全部轉(zhuǎn)錄。2)而當(dāng)培養(yǎng)基中色氨酸的濃度高時(shí),核糖體可順利通過兩個(gè)色氨酸密碼子,在4區(qū)被轉(zhuǎn)錄之前,核糖體就到達(dá)2區(qū),這樣使2-3不能配對(duì),3-4區(qū)可以著有配對(duì)形成莖-環(huán)狀終止結(jié)構(gòu),轉(zhuǎn)錄停止,trp操縱子中的結(jié)構(gòu)基因被關(guān)閉而不再合成色氨酸。所以,弱化子對(duì)RNA聚合酶的影響依賴于前導(dǎo)肽翻譯中核糖體所處的位置。
54.半乳糖操縱子包括3個(gè)結(jié)構(gòu)基因:異構(gòu)酶(galE),半乳糖-磷酸尿嘧啶核苷轉(zhuǎn)移酶(galT),半乳糖激酶(galK)。這三個(gè)酶的作用是使半乳糖變成葡萄糖-1-磷酸。
55.Gal操縱子與lac操縱子所不同的是galR與galE、T、K及操縱區(qū)O等的距離都很遠(yuǎn),而galR產(chǎn)物對(duì)galO的作用與lacI-lacO的作用相同。
56.基因表達(dá)的轉(zhuǎn)錄調(diào)控是生物最經(jīng)濟(jì)的調(diào)控方式。轉(zhuǎn)錄生成mRNA以后,再翻譯生成或翻譯后水平進(jìn)行“微調(diào)”,是對(duì)轉(zhuǎn)錄調(diào)控的補(bǔ)充,它使基因表達(dá)的調(diào)控更加適應(yīng)生物本身的需求和外界條件的變化。
57.mRNA 3’端poly(A)的長短對(duì)翻譯效率有很大影響。細(xì)胞中蛋白質(zhì)合成旺盛時(shí),mRNA鏈上核糖體數(shù)量就多,mRNA鏈上的poly(A)也較長。當(dāng)某些mRNA鏈不再被翻譯時(shí),核糖體就被釋放出來,其poly(A)也相應(yīng)縮短。
七、基因的表達(dá)與調(diào)控(下)
58.基因擴(kuò)增:指某些基因的拷貝數(shù)專一性大量增加的現(xiàn)象,它使細(xì)胞在短時(shí)期內(nèi)產(chǎn)生大量的基因產(chǎn)物以滿足生長發(fā)育的需要,是基因活性調(diào)控的一種方式。
59.基因重排:將一個(gè)基因從遠(yuǎn)離啟動(dòng)子的地方移到距離它很近的位點(diǎn)從而啟動(dòng)轉(zhuǎn)錄,這種方式被稱為基因重排。
60.DNA的甲基化能引起染色質(zhì)結(jié)構(gòu)、DNA構(gòu)象、DNA穩(wěn)定性及DNA與蛋白質(zhì)相互作用方式的改變,從而控制基因表達(dá)。
61.真核生物的轉(zhuǎn)錄調(diào)控大多數(shù)是通過順式作用元件和反式作用因子復(fù)雜的相互作用來實(shí)現(xiàn)的。
順式作用元件:是指存在于基因DNA中的特異性調(diào)控序列。真核基因的順式作用元件按照功能可以分為啟動(dòng)子和增強(qiáng)子。
反式作用因子:是能直接或間接地識(shí)別或結(jié)合在各種順式作用元件8-12bp核心序列上,參與調(diào)控靶基因轉(zhuǎn)錄效率的一組蛋白質(zhì)。順式作用元件必須與反式作用因子結(jié)合才能對(duì)轉(zhuǎn)錄起到調(diào)控作用。
62.蛋白激酶根據(jù)底物蛋白質(zhì)被磷酸化的氨基酸殘基種類可以分為三大類:1)絲氨酸/蘇氨酸型;2)酪氨酸型;3)組氨酸型。
63.依賴于cAMP的蛋白激酶稱為A激酶(PKA)。依賴于Ca2+的蛋白激酶稱為C激酶(PKC)。
64.酪氨酸激酶(PTK)包含跨膜受體家族與胞質(zhì)非受體家族兩大類??缒な荏w家族由胞外結(jié)合配體結(jié)構(gòu)域、跨膜結(jié)構(gòu)域和細(xì)胞質(zhì)激酶結(jié)構(gòu)域組成。
65.應(yīng)答元件:能與某個(gè)(類)專一蛋白因子結(jié)合,從而控制基因特異性表達(dá)的DNA上游序列。
66.熱激蛋白調(diào)控基因表達(dá)的機(jī)制:1)在沒有受熱或其他環(huán)境脅迫時(shí),HSF主要以單體形式存在于細(xì)胞質(zhì)和核內(nèi)。2)受到熱激活其他環(huán)境脅迫時(shí),細(xì)胞內(nèi)變形蛋白增多,它們都與HSF競(jìng)爭(zhēng)結(jié)合Hsp70,從而釋放HSF,使之形成三體并輸入核內(nèi),HSF被迅速磷酸化。3)HSF與HSE的特異性結(jié)合,引起包括Hsp70在內(nèi)的許多熱激應(yīng)答基因表達(dá),大量產(chǎn)生Hsp70蛋白。4)隨著熱激溫度的消失,細(xì)胞出現(xiàn)大量游離的Hsp70蛋白,它們與HSF結(jié)合,形成沒有DNA結(jié)合能力的單體并脫離DNA。
八、疾病與人類健康
67.癌基因可分為兩大類:病毒癌基因和細(xì)胞轉(zhuǎn)化基因。
第四篇:分子生物學(xué)實(shí)習(xí)總結(jié)
分子生物學(xué)實(shí)習(xí)總結(jié)
三天的分子生物學(xué)實(shí)習(xí),我能認(rèn)真聽老師的講解和很好的按照老師的安排完成實(shí)驗(yàn)。期間,接觸和學(xué)習(xí)到了很多有關(guān)分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)的方法、儀器的使用、技術(shù),而且對(duì)分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)有一個(gè)大致的了解,學(xué)習(xí)到很多以前沒有接觸過的知識(shí)。
這幾天來做的不足的地方有:
1.預(yù)習(xí)不夠充分。只是瀏覽了實(shí)驗(yàn)報(bào)告上的原理、操作等內(nèi)容,并沒有深入了解每一個(gè)步驟的操作會(huì)對(duì)實(shí)驗(yàn)有什么的作用和影響。實(shí)驗(yàn)失敗了,不能自主找到原因。
2.實(shí)驗(yàn)操作過程不夠細(xì)心。實(shí)驗(yàn)要求十分細(xì)心,嚴(yán)謹(jǐn)和專注。實(shí)驗(yàn)中很多細(xì)小的地方還是沒有很好的注意到。
3.遇到不懂的沒有及時(shí)發(fā)問。實(shí)驗(yàn)就是一個(gè)讓我們實(shí)操的過程,一邊操作一邊鞏固書本上的知識(shí)。過程中,遇到不明白的地方應(yīng)該及時(shí)問別人活著自己翻閱資料,力求把實(shí)驗(yàn)弄透徹。
但是我還是有很多收獲的:
1.對(duì)分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)有了了解。例如實(shí)驗(yàn)的基本的流程和操作,常用的方法等基礎(chǔ)知識(shí)已經(jīng)有了一定了解,對(duì)以后的實(shí)驗(yàn)會(huì)有一定的幫助。
2.最基本的移液槍、離心機(jī)、渦旋器等的使用還有實(shí)驗(yàn)中的PCR儀、電泳等有一定的認(rèn)。3.學(xué)會(huì)了嚴(yán)謹(jǐn)和細(xì)心。實(shí)驗(yàn)所用的材料都是比較昂貴的,而且實(shí)驗(yàn)只要一步錯(cuò)了,就得重做。所以需要非常嚴(yán)謹(jǐn)。不僅僅是分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn),其他實(shí)驗(yàn)也要求,所以培養(yǎng)這個(gè)有點(diǎn)對(duì)以后的實(shí)驗(yàn)非常有好處。
4.學(xué)會(huì)了堅(jiān)持。很多次因?yàn)閷?shí)驗(yàn)做的時(shí)間很長,大家都會(huì)很累,但是,還是要堅(jiān)持,一點(diǎn)點(diǎn)累都受不了是不能把實(shí)驗(yàn)做好的。開始慢慢了解到做科研的人員的辛酸,長時(shí)間整天呆在實(shí)驗(yàn)室做實(shí)驗(yàn),這需要很大的毅力。
5.把握實(shí)驗(yàn)機(jī)會(huì),讓自己學(xué)得更多。實(shí)驗(yàn)過程中,只要有實(shí)操的機(jī)會(huì),我都會(huì)去操作。因?yàn)檎f和做是不一樣的。而且在操作中能加深鞏固知識(shí)和學(xué)得更加深入。
三天的分子生物學(xué)實(shí)習(xí)雖然很累,因?yàn)橐焯烊ピ簶?,而卻實(shí)驗(yàn)時(shí)間都比較長。但是還是很有意義的,因?yàn)閷W(xué)習(xí)到很到東西,收獲了很多。
老師也為我們準(zhǔn)備了很多的材料和準(zhǔn)備,實(shí)驗(yàn)才做得那么快和順利,其實(shí),實(shí)驗(yàn)室簡(jiǎn)化了很多了,而且我們所做的實(shí)驗(yàn)都是已經(jīng)設(shè)計(jì)好的,按照操作做就行了。如果時(shí)間和資金允許,應(yīng)該設(shè)立一些自主完成的實(shí)驗(yàn),這樣可以培養(yǎng)我們更加多的能力,開闊知識(shí)面和拓寬思維。
第五篇:分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)總結(jié)
分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)
1.TOMY全自動(dòng)滅菌鍋的使用
(1)檢查排放蒸汽的水壺,腔體內(nèi)的水位與托板齊平。(2)SET鍵設(shè)置溫度和時(shí)間(121℃,20min)(3)關(guān)閉排氣閥,Start機(jī)器開始運(yùn)行,Check Heat檢查設(shè)置的溫度,Stop鍵終止機(jī)器運(yùn)行。(4)程序運(yùn)行結(jié)束,旋開排氣閥或機(jī)器自行排氣至壓力為0。溫度降至80℃以下壓力為0時(shí)方可開蓋。運(yùn)行過程中勿接觸蓋子。(5)腔體內(nèi)經(jīng)常清潔。2.LB液體培養(yǎng)基(1000mL)
將胰蛋白胨10g,酵母提取物5g,氯化鈉10g完全溶解在950mL去離子水中,用NaOH調(diào)節(jié)pH至7.0,加入去離子水至總體積為1000mL,121℃濕熱滅菌20min。冷卻后4℃保存?zhèn)溆?。固體還要再加瓊脂。3.堿裂解法
堿裂解法提取質(zhì)粒是根據(jù)共價(jià)閉合環(huán)狀質(zhì)粒DNA與線性染色體DNA在拓?fù)鋵W(xué)上的差異來分離它們的。在pH值介于12.0~12.5這個(gè)狹窄的范圍內(nèi),線性的DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)解開而被變性,盡管在這樣的條件下,共價(jià)閉合環(huán)狀質(zhì)粒DNA的氫鍵會(huì)斷裂,但兩條互補(bǔ)鏈彼此纏繞,仍會(huì)緊密的結(jié)合在一起。當(dāng)加入 pH4.8的乙酸鉀高鹽緩沖液,恢復(fù)pH至中性時(shí),共價(jià)閉合環(huán)狀質(zhì)粒DNA的兩條互補(bǔ)鏈仍保持在一起,因此復(fù)性迅速而準(zhǔn)確,而線性的染色體DNA的兩條互補(bǔ)鏈彼此完全分開,復(fù)性就不會(huì)那么迅速而準(zhǔn)確,它們纏繞形成網(wǎng)狀結(jié)構(gòu)。通過離心,染色體DNA與不穩(wěn)定的大分子RNA,蛋白質(zhì)-SDS復(fù)合物等一起沉淀下來而被除去。
溶液Ⅰ:葡萄糖,Tris-HCl,EDTA 葡萄糖能增加溶液的黏度,防止DNA受機(jī)械作用而降解。EDTA可螯合Mg2+、Ca2+等金屬離子,抑制DNase對(duì)DNA的降解作用。溶液Ⅱ:氫氧化鈉,SDS 氫氧化鈉加入后堿性環(huán)境12-12.5促使染色體DNA與質(zhì)粒的變性解離成單鏈。SDS是一種陰離子去垢劑,它的主要作用有:①溶解細(xì)胞膜上的脂肪與蛋白,因而溶解膜蛋白而破壞細(xì)胞膜;②解聚細(xì)胞中的核蛋白,使蛋白質(zhì)與DNA分開;③SDS能與蛋白質(zhì)結(jié)合成為SDS-蛋白質(zhì)復(fù)合物,使蛋白質(zhì)變性而沉淀;④SDS能抑制核酸酶的作用,防止對(duì)DNA的降解。
溶液Ⅲ:乙酸鉀。用pH4.2的KAc溶液是為了調(diào)整溶液pH至中性,使變性的質(zhì)粒DNA能夠復(fù)性,并能穩(wěn)定存在。而高鹽的3mol/L醋酸鉀(KAc)有利于變性的大分子染色體DNA、RNA以及SDS-蛋白質(zhì)復(fù)合物凝聚而沉淀。4.loading buffer 電泳指示劑溴酚蘭在堿性液體中呈紫蘭色,一般與蔗糖、甘油組成上樣緩沖液。作用:①增加樣品比重,以確保DNA均勻沉入加樣孔內(nèi)。②形成肉眼可見的指示帶,預(yù)測(cè)核酸電泳的速度和位置。③使樣品呈色,使加樣操作更方便。5.限制性內(nèi)切酶(I型)限制性內(nèi)切酶:能識(shí)別專一的核苷酸順序,并在識(shí)別點(diǎn)附近的一些核苷酸上切割DNA分子中的雙鏈,但是切割的核苷酸順序沒有專一性,是隨機(jī)的。
(II型)限制性內(nèi)切酶:能識(shí)別專一的核苷酸順序,并在該順序內(nèi)的固定位置上切割雙鏈。這類限制性內(nèi)切酶的識(shí)別和切割的核苷酸都是專一的,因此,這種限制性內(nèi)切酶是DNA重組技術(shù)中最常用的工具酶之一。
(III型)限制性內(nèi)切酶:也有專一的識(shí)別順序,但不是對(duì)稱的回文順序,在識(shí)別順序旁邊幾個(gè)核苷酸對(duì)的固定位置上切割雙鏈。但這幾個(gè)核苷酸對(duì)不是特異性的。因此,這種限制性內(nèi)切酶切割后產(chǎn)生的一定長度DNA片段,具有各種單鏈末端。因此不能應(yīng)用于基因克隆。6.引物設(shè)計(jì)和選擇目的DNA序列區(qū)域時(shí)遵循下列原則: 引物長度約為16~30bp;引物中G+C含量通常為40%~60%,可按Tm=4(G+C)+2(A+T)粗略估計(jì)引物的解鏈溫度;四種堿基應(yīng)隨機(jī)分布,在3’端不存在連續(xù)3個(gè)G或C,因這樣易導(dǎo)致錯(cuò)誤;引物3’端最好與目的序列閱讀框架中密碼子第一或第二位核苷酸對(duì)應(yīng),以減少由于密碼子擺動(dòng)產(chǎn)生的不配對(duì);在引物內(nèi),尤其在3’端應(yīng)不存在二級(jí)結(jié)構(gòu);兩引物之間尤其在3’端不能互補(bǔ),以防出現(xiàn)引物二聚體,減少產(chǎn)量;引物5’端對(duì)擴(kuò)增特異性影響不大,可引入酶切位點(diǎn)或突變位點(diǎn);引物不與模板結(jié)合位點(diǎn)以外的序列互補(bǔ);簡(jiǎn)并引物應(yīng)選用簡(jiǎn)并程度低的密碼子;引物的濃度一般為0.1~0.5μmol/L,引物濃度偏高會(huì)引起錯(cuò)配和非特異性產(chǎn)物擴(kuò)增,引物濃度偏低則降低產(chǎn)量。7.dNTP 常用的濃度為20~200μmol/L,而且4種dNTP的終濃度相等,以減少合成中由于某種dNTP的不足而出現(xiàn)的錯(cuò)誤摻入;dNTP濃度過高雖可加快反應(yīng)速度,但會(huì)增加堿基的錯(cuò)誤摻入率,同時(shí)會(huì)抑制Taq DNA聚合酶的反應(yīng)活性;適當(dāng)?shù)牡蜐舛葧?huì)提高反應(yīng)的精確度;注意協(xié)調(diào)Mg2+濃度和dNTP濃度之間的關(guān)系。8.感受態(tài)
處于對(duì)數(shù)生長期的細(xì)菌經(jīng)低溫CaCl2處理后接受外源DNA的能力顯著增加。細(xì)菌處于容易吸收外源 DNA的狀態(tài)叫感受態(tài)。在自然條件下,很多質(zhì)粒都可通過細(xì)菌接合作用轉(zhuǎn)移到新的宿主內(nèi),但在人工構(gòu)建的質(zhì)粒載體中,一般缺乏此種轉(zhuǎn)移所必需的mob 基因,因此不能自行完成從一個(gè)細(xì)胞到另一個(gè)細(xì)胞的接合轉(zhuǎn)移。如需將質(zhì)粒載體轉(zhuǎn)移進(jìn)受體細(xì)菌,需誘導(dǎo)受體細(xì)菌產(chǎn)生一種短暫的感受態(tài),以攝取外源DNA。9.轉(zhuǎn)化
轉(zhuǎn)化是將外源DNA 分子引入受體細(xì)胞,使之獲得新的遺傳性狀的一種手段。轉(zhuǎn)化過程所用的受體細(xì)胞一般是限制修飾系統(tǒng)缺陷的變異株,即不含限制性內(nèi)切酶和甲基化酶的突變體(R-,M-),它可以容忍外源DNA 分子進(jìn)入體內(nèi)并穩(wěn)定地遺傳給后代。它是微生物遺傳、分子遺傳、基因工程等研究領(lǐng)域的基本實(shí)驗(yàn)技術(shù)。10.DNA連接酶
有兩種:T4噬菌體DNA連接酶和大腸桿菌DNA連接酶;DNA重組的方法主要有粘端連接法和平端連接法,為了防止載體本身的自連,可以通過牛小腸堿性磷酸酶CIP處理克服; 連接反應(yīng)的溫度在37℃時(shí)有利于連接酶的活性。但是在這個(gè)溫度下,粘性末端的氫鍵結(jié)合是不穩(wěn)定的。因此人們找到了一個(gè)折中的溫度,即12~16℃,連接12~16h(過夜),這樣既可最大限度地發(fā)揮連接酶的活性,又兼顧到短暫配對(duì)結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定;
pMD18-T Vector 是一種高效克隆PCR 產(chǎn)物(TA Cloning)的專用載體,該載體由pUC18 載體改建并在其3’端添加“T”而成
大部分耐熱性DNA聚合酶進(jìn)行PCR反應(yīng)時(shí)都有在PCR產(chǎn)物的3’末端添加一個(gè)“A”的特性,所以使用本制品可以大大提高PCR產(chǎn)物的連接、克隆效率;
轉(zhuǎn)化是指質(zhì)粒DNA或以它為載體構(gòu)建的重組子導(dǎo)入細(xì)菌的過程 11.α互補(bǔ)
重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化宿主細(xì)胞后,還需對(duì)轉(zhuǎn)化菌落進(jìn)行篩選鑒定。利用α互補(bǔ)現(xiàn)象進(jìn)行篩選是最常用的一種鑒定方法; α互補(bǔ):質(zhì)粒載體上lacZ’基因編碼的α肽段與失去了正常氨基端的β-半乳糖苷酶突變受體菌之間實(shí)現(xiàn)互補(bǔ)的現(xiàn)象,由α互補(bǔ)而形成的有功能活性的β半乳糖苷酶,可以用Xgal顯色測(cè)定出來;任何攜帶著lacZ’基因的質(zhì)粒載體在轉(zhuǎn)化β半乳糖苷酶突變的大腸桿菌細(xì)胞后,在含有Xgal的培養(yǎng)基平板上形成藍(lán)色菌落,而含有重組質(zhì)粒載體的克隆往往是白色菌落。